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2025/09/05

Streptomyces yogyakartensis、Streptomyces cangkringensis及びStreptomyces indonesiensisの再分類に伴うStreptomyces javensisとStreptomyces rhizosphaericusの記載変更

論文タイトル
Emended descriptions of Streptomyces javensis and Streptomyces rhizosphaericus based on reclassifications of Streptomyces yogyakartensis, Streptomyces cangkringensis, and Streptomyces indonesiensis
論文タイトル(訳)
Streptomyces yogyakartensis、Streptomyces cangkringensis及びStreptomyces indonesiensisの再分類に伴うStreptomyces javensisとStreptomyces rhizosphaericusの記載変更
DOI
10.1099/ijsem.0.006881
ジャーナル名
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
巻号
Vol.75 Issue 8 (2025)
著者名(敬称略)
小牧 久幸
所属
独立行政法人 製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター(NBRC)
著者からのひと言
放線菌が生産する抗生物質等の二次代謝産物の種類は株に特異的であって、分類学的な種とは無関係だと信じられていました。しかし、この論文では、最新の基準に従った適切な分類によって、同種であれば株が違ってもポリケチドや非リボソームペプチドに代表される二次代謝産物の生合成遺伝子群がゲノム中に良く保存されていることを示しました。これによりPKSやNRPS遺伝子群の種類が分類や同定の指標になる可能性があります。

抄訳

Streptomyces javensis、Streptomyces yogyakartensis及びStreptomyces violaceusnigerは基準株の16S rRNA遺伝子塩基配列が一致する。これら3種の関係を調べた。全ゲノム配列を用いたDNA-DNA交雑試験でS. javensis JCM 11446TとS. yogyakartensis JCM 11448Tの相同性は89.4%だったが、これら2株に対するS. violaceusniger NBRC 13459Tの相同性は70%に満たなかった。表現性状やゲノム中のⅠ型ポリケチド合成酵素(PKS)及び非リボソームペプチド合成酵素(NRPS)遺伝子群も類似したので、S. yogyakartensisをS. javensisに再分類した。また、本研究の過程でStreptomyces rhizosphaericus、Streptomyces cangkringensis及びStreptomyces indonesiensisが同種である可能性が示唆された。これらの基準株間ではDNA-DNA相同性が97%を超え、表現性状も類似し、殆どのPKS及びNRPS遺伝子群が保存されていたので、S. cangkringensisとS. indonesiensisをS. rhizosphaericusに再分類した。以上の再分類に伴いS. javensisとS. rhizosphaericusの記載を変更した。

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