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2026/01/06

免疫不全状態の日本人患者から分離された新規 Mycobacterium 属(新種)の完全ゲノム配列

論文タイトル
Complete genome sequence of a new Mycobacterium sp. nov. from a compromised Japanese individual
論文タイトル(訳)
免疫不全状態の日本人患者から分離された新規 Mycobacterium 属(新種)の完全ゲノム配列
DOI
10.1128/mra.00421-25
ジャーナル名
Microbiology Resource Announcements
巻号
Microbiology Resource Announcements Ahead of Print
著者名(敬称略)
浅井信博 三鴨廣繁 他
所属
愛知医科大学医学部 臨床感染症学講座

抄訳

本報告は、血液悪性腫瘍を有する免疫不全の日本人患者から分離された新規Mycobacterium(strain AMU20-3851;“Mycobacterium nagakutense”として言及)の完全ゲノム配列を提示するアナウンスメントである。菌は血液培養(約90時間)で検出され、Ogawa培地で培養後、フェノール/クロロホルム法でDNA抽出し、PacBio Sequel II(HiFi/CCS)でシーケンスを実施した。得られたHiFiリードをhifiasmでアセンブルし、dnaA開始に調整、NCBI PGAPで注釈付けした。染色体は6,056,820 bp、G+C 68%で、5,822遺伝子を予測し、平均311×の深度で決定された。ANI解析では近縁種(M. diernhoferi 90.5%など)と種境界以下であり、新種の比較ゲノム・系統解析の基盤データとなる。データはGenBank(GCF_043974665.1)等に登録済みである。

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