抄訳
薬剤耐性菌の世界的拡散はゲノム研究で解明が進むが、採取期間や地域の不均一さから、パンデミック確立の詳細過程は不明であった。本研究では国際的高リスククローンであるフルオロキノロン耐性(FQ-R)大腸菌 ST131 に着目し、札幌圏を対象に統一期間(2021–2022年)でヒト・伴侶動物・下水・家畜を統合し、世帯レベルまで捉えるワンヘルス枠組みを構築した。大腸菌2,358株のうち FQ-R 235株(ST131 88株を含む)をゲノム解析した結果、ST131 は高いクローン多様性の中に明確な集団構造をもち、ヒトと伴侶動物で共有されるサブクラスターが認められた。コアゲノム SNP 解析からは、健常人の保菌、無症候のヒト間伝播、世帯内のヒト–伴侶動物間伝播が示唆された。これら保菌株は多様な耐性遺伝子・病原因子を保有し臨床株と酷似しており、院内へ拡散が示唆された。国際ゲノムとの統合解析では、札幌の伝播が ST131 の世界的拡大の一部であることが示された。本研究は地域社会から世界規模への耐性菌拡散を解明する拡張可能なモデルであり、地域・世帯レベルでの介入の必要性を示す。