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2026/11/09

幾何学速度論シミュレーションが明らかにする人工DNAナノ/マイクロ粒子モーターの運動速度・走行距離・一方向性の決定要因

論文タイトル
Artificial DNA-nano/microparticle motors: Factors governing speed, run length, and unidirectionality revealed by geometry-based kinetic simulations
論文タイトル(訳)
幾何学速度論シミュレーションが明らかにする人工DNAナノ/マイクロ粒子モーターの運動速度・走行距離・一方向性の決定要因
DOI
10.1016/j.bpj.2026.09.041
ジャーナル名
Biophysical Journal
巻号
Biophysical Journal, 2026; 125, 6272-6290
著者名(敬称略)
原島 崇徳 飯野 亮太
所属
自然科学研究機構 分子科学研究所
総合研究大学院大学
著者からのひと言
我々は、生体内のモータータンパク質に匹敵する分子モーターを人工的に創ることを目指して研究しています。本論文では、DNA人工分子モーターの運動速度・走行距離・一方向性を決める仕組みをシミュレーションで解明し、さらなる高性能化への予測を立てました。今回の予測に立脚して、今後はDNA/RNA配列の最適化や、より高速に反応する酵素の利用・開発を進め、更に高性能な人工分子モーターを実現したいと考えています。

抄訳

DNAナノ/マイクロ粒子モーターは、粒子表面のDNAと基板上のRNAとの結合、および酵素によるRNA分解を繰り返して自律的に運動する人工分子モーターである。本研究は、粒子と基板の幾何学と確率的な反応進行を組み込んだ数理シミュレーションにより、粒子径100~5000 nmのモーターの運動を解析した。その結果、粒子径に依存してステップ長と停止時間が増加し、両者が相殺するため運動速度が粒子径にほとんど依存しないことを明らかにした。一方、粒子径が大きくなるにつれて走行距離は増加し一方向性も向上した。走行距離の増加はレールからの脱離確率の低減に起因し、一方向性の向上は結合点分布の前進方向への平均化に起因することを明らかにした。さらに、結合形成からRNA分解に至る三段階の反応素過程を全て10倍速めると、200 nm/sを超える高速化が可能と予測した。本成果は、粒子径と反応速度の両面から高性能な人工分子モーターを設計する指針を与えた。

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